Input FastA file name: 41808_0_18_MAR_14_48_56_extlz_sesimcmc.fasta
The slow optimisation mode makes no sense when the site lenght is pre-given.Gene Id | Position | Length | Score | Direction | Site in sequence | Site-as-in-motif | |
1 | 102 | 8 | 8.697 | < | TtTAATTT | AAATTAaA | |
10 | 101 | 8 | 6.919 | < | TtTAAATG | CATTTAaA | |
11 | 105 | 8 | 7.723 | > | TCATTAtG | TCATTAtG | |
12 | 104 | 8 | 8.697 | > | AAATTAaA | AAATTAaA | |
13 | 102 | 8 | 5.723 | < | GgTAATGG | CCATTAcC | |
14 | 103 | 8 | 8.545 | < | TgTAATTA | TAATTAcA | |
15 | 102 | 8 | 9.919 | < | TtTAATTG | CAATTAaA | |
16 | 102 | 8 | 9.407 | < | TtTAATGA | TCATTAaA | |
2 | 109 | 8 | 7.097 | > | CTATTAaG | CTATTAaG | |
3 | 109 | 8 | 8.597 | > | TAATTAtG | TAATTAtG | |
4 | 108 | 8 | 7.282 | > | TAAGTAaA | TAAGTAaA | |
5 | 106 | 8 | 7.67 | > | TCATTAgA | TCATTAgA | |
6 | 103 | 8 | 7.012 | > | CAATTAtC | CAATTAtC | |
7 | 108 | 8 | 9.919 | < | CtTAATTA | TAATTAaG | |
8 | 107 | 8 | 9.045 | > | TCATTAaG | TCATTAaG | |
9 | 105 | 8 | 7.82 | > | CAATTAgG | CAATTAgG |
1 AAATTAaA 10 CATTTAaA 11 TCATTAtG 12 AAATTAaA 13 CCATTAcC 14 TAATTAcA 15 CAATTAaA 16 TCATTAaA 2 CTATTAaG 3 TAATTAtG 4 TAAGTAaA 5 TCATTAgA 6 CAATTAtC 7 TAATTAaG 8 TCATTAaG 9 CAATTAgG