Looking for DNA motifs Gibbs sampler (SeSiMCMC) result.

Input FastA file name: 805462_0_03_MAR_21_25_30_extlz_sesimcmc.fasta

The best information content for different site lengthes:

Length
6-0.0411855
7-0.0464594
8-0.0349403***
9-0.035861

The sampler was looking for sites on both strands of 41 sequences of length from 209 through 250.

The site length found is 8.
The sampler has tested the lengths in [6,9].
The motif is formed by 41 motif sites.

All the positions are 0-based.

The description of sites
Gene IdPositionLengthScoreDirectionSite in sequenceSite-as-in-motif
110189.42>tcAATTAttcAATTAt
1010387.191>gcCATTAagcCATTAa
1110687.799<aTAATTacgtAATTAt
1210389.42<aTAATTgatcAATTAt
1311085.202>taAATCTttaAATCTt
1411184.74<aATATTaattAATATt
1510589.07<aTAATTtataAATTAt
1610187.799>gtAATTAtgtAATTAt
1711385.892>taAATTTgtaAATTTg
1810885.512<tAAATGgatcCATTTa
1910686.807<aTTATGgatcCATAAt
210184.981<tTGATGtcgaCATCAa
2010688.423<tTAATTgcgcAATTAa
2111688.041<aTAATTttaaAATTAt
2210186.755>tgAATTAgtgAATTAg
2310588.041<aTAATTttaaAATTAt
2411884.582<aTAAATttaaATTTAt
2511187.361>gaAATAAtgaAATAAt
2610688.403>taAATTAataAATTAa
2710787.042>gcAATAAagcAATAAa
2810187.69>taAATAAttaAATAAt
2910383.54>ggAATATaggAATATa
311084.104>acCATTAcacCATTAc
3010188.129<aTAATTaattAATTAt
3110589.09<aTAATTgcgcAATTAt
3210285.428>aaCATAAtaaCATAAt
3310684.425>acAAATAtacAAATAt
3410781.044>ggCTTCAtggCTTCAt
3512187.921<cTAATTgcgcAATTAg
3610486.025<tTAATGcatgCATTAa
3710785.513>aaAATCAaaaAATCAa
3810886.748>ttAATAAtttAATAAt
3910788.403<tTAATTtataAATTAa
410282.096>ccCATTTgccCATTTg
4011387.52>tcCATTAatcCATTAa
4110585.523<cTAATGcatgCATTAg
51008-1.413>acGATCCgacGATCCg
610388.25>tcAATTAgtcAATTAg
711085.751>gtAATAAagtAATAAa
81018-3.702<aTGCGCgcgcGCGCAt
910085.912>gcAATTTggcAATTTg

The list of sites
 1    tcAATTAt
 10   gcCATTAa
 11   gtAATTAt
 12   tcAATTAt
 13   taAATCTt
 14   ttAATATt
 15   taAATTAt
 16   gtAATTAt
 17   taAATTTg
 18   tcCATTTa
 19   tcCATAAt
 2    gaCATCAa
 20   gcAATTAa
 21   aaAATTAt
 22   tgAATTAg
 23   aaAATTAt
 24   aaATTTAt
 25   gaAATAAt
 26   taAATTAa
 27   gcAATAAa
 28   taAATAAt
 29   ggAATATa
 3    acCATTAc
 30   ttAATTAt
 31   gcAATTAt
 32   aaCATAAt
 33   acAAATAt
 34   ggCTTCAt
 35   gcAATTAg
 36   tgCATTAa
 37   aaAATCAa
 38   ttAATAAt
 39   taAATTAa
 4    ccCATTTg
 40   tcCATTAa
 41   tgCATTAg
 5    acGATCCg
 6    tcAATTAg
 7    gtAATAAa
 8    gcGCGCAt
 9    gcAATTTg