Looking for DNA motifs Gibbs sampler (SeSiMCMC) result.

Input FastA file name: 10936_0_18_MAR_14_47_57_extlz_sesimcmc.fasta

The slow optimisation mode makes no sense when the site lenght is pre-given.
The sampler was looking for sites on both strands of 56 sequences of length from 213 through 298.

The site length found is 8.
The motif is formed by 56 motif sites.

All the positions are 0-based.

The description of sites
Gene IdPositionLengthScoreDirectionSite in sequenceSite-as-in-motif
11058-1.899>GgGAAATcGgGAAATc
1010387.053>TtCAATTaTtCAATTa
1112983.132>TtAATTTaTtAATTTa
1210182.967<cACTCAcCGgTGAGTg
1310789.419<cAATTAaTAtTAATTg
1415187.456<tAATTAtTAaTAATTa
1512489.476<tAATTAaTAtTAATTa
1610887.906>GgTAATTaGgTAATTa
1710785.502>AtAGATTgAtAGATTg
1812686.444>AcTAATGaAcTAATGa
1910085.273<tAAGTAaTAtTACTTa
210086.996>TtCAATTgTtCAATTg
2012586.51>TtTGATTtTtTGATTt
2115086.701<aAATTAcTAgTAATTt
2211884.159<tAAACAgATcTGTTTa
2314484.231<cAATCGtTAaCGATTg
2411586.16>AgCAATTaAgCAATTa
2510487.997>GtTGATTgGtTGATTg
2610888.356>GcTAATTgGcTAATTg
2710585.338<tACTTAaCGtTAAGTa
2810385.502>AtGGATTgAtGGATTg
2910681.074>AcTGACGgAcTGACGg
311185.598<tCATTAcATgTAATGa
3010289.08>GtTAATTgGtTAATTg
3110187.161>AgTGATTaAgTGATTa
3210988.054>GtTGATTaGtTGATTa
3310682.714<gAATAAgATcTTATTc
3411386.303<tAATTTaATtAAATTa
3510586.869>GcTAATTtGcTAATTt
3610387.06>TaTAATTgTaTAATTg
3710289.137>GtTAATTaGtTAATTa
3810289.419>AtTAATTgAtTAATTg
3910687.456<tAATTAtTAaTAATTa
410882.889>AtCTATTtAtCTATTt
4010787.849<cAATTAcATgTAATTg
4110588.752<tAATTAgTAcTAATTa
4210487.593<aAATTAaATtTAATTt
4310783.183>TcTGATAgTcTGATAg
4411882.805<cAATAGcATgCTATTg
4510586.869<aAATTAgCGcTAATTt
4610582.88<cCATCGgCGcCGATGg
4710486.773<cCATTAaATtTAATGg
4811286.105<tCATTAgCGcTAATGa
4911185.977>TaTGATTgTaTGATTg
510883.61<tCATTTgTAcAAATGa
5010684.764>AtCGATTtAtCGATTt
5113086.305<tAAATAaTAtTATTTa
5210282.855>TtGGATGgTtGGATGg
5311285.698<cAATGAaTAtTCATTg
5410885.222<tAAACAaTAtTGTTTa
5510289.476>AtTAATTaAtTAATTa
5610885.072>GgGAATTaGgGAATTa
610988.413<tAATTAgCGcTAATTa
710488.356>GcTAATTgGcTAATTg
811289.08>TtTAATTgTtTAATTg
910588.356>GcTAATTgGcTAATTg

The list of sites
 1    GgGAAATc
 10   TtCAATTa
 11   TtAATTTa
 12   GgTGAGTg
 13   AtTAATTg
 14   AaTAATTa
 15   AtTAATTa
 16   GgTAATTa
 17   AtAGATTg
 18   AcTAATGa
 19   AtTACTTa
 2    TtCAATTg
 20   TtTGATTt
 21   AgTAATTt
 22   TcTGTTTa
 23   AaCGATTg
 24   AgCAATTa
 25   GtTGATTg
 26   GcTAATTg
 27   GtTAAGTa
 28   AtGGATTg
 29   AcTGACGg
 3    TgTAATGa
 30   GtTAATTg
 31   AgTGATTa
 32   GtTGATTa
 33   TcTTATTc
 34   TtAAATTa
 35   GcTAATTt
 36   TaTAATTg
 37   GtTAATTa
 38   AtTAATTg
 39   AaTAATTa
 4    AtCTATTt
 40   TgTAATTg
 41   AcTAATTa
 42   TtTAATTt
 43   TcTGATAg
 44   TgCTATTg
 45   GcTAATTt
 46   GcCGATGg
 47   TtTAATGg
 48   GcTAATGa
 49   TaTGATTg
 5    AcAAATGa
 50   AtCGATTt
 51   AtTATTTa
 52   TtGGATGg
 53   AtTCATTg
 54   AtTGTTTa
 55   AtTAATTa
 56   GgGAATTa
 6    GcTAATTa
 7    GcTAATTg
 8    TtTAATTg
 9    GcTAATTg