Looking for DNA motifs Gibbs sampler (SeSiMCMC) result.

Input FastA file name: 489371_0_18_MAR_14_47_54_extlz_sesimcmc.fasta

The slow optimisation mode makes no sense when the site lenght is pre-given.
The sampler was looking for sites on both strands of 60 sequences of length from 209 through 296.

The site length found is 6.
The motif is formed by 60 motif sites.

All the positions are 0-based.

The description of sites
Gene IdPositionLengthScoreDirectionSite in sequenceSite-as-in-motif
110768.108<aTaATTAATtAt
1011162.584>CATtTgCATtTg
1110766.004<tTtATGCATaAa
121006-2.153<aCgATCGATcGt
1310566.47>AATtAgAATtAg
1411267.531>AATaAaAATaAa
1510060.2434>AATgCgAATgCg
1610260.463<aAtTTGCAAaTt
1710566.211>CATtAaCATtAa
1811965.998<aTcATTAATgAt
1910866.263>AATaAgAATaAg
210367.738>AATtAaAATtAa
2010666.581<aTaATGCATtAt
2110467.738<tTaATTAATtAa
2211167.901<aTtATTAATaAt
2311867.738<tTaATTAATtAa
2410864.711>AATtAcAATtAc
2510368.108<aTaATTAATtAt
2610866.004>CATaAaCATaAa
2711165.543>AATaTtAATaTt
2810965.998>AATgAtAATgAt
2910467.901>AATaAtAATaAt
310267.738>AATtAaAATtAa
3010368.108>AATtAtAATtAt
3111365.38<tAaATTAATtTa
3210663.156>ATTaAaATTaAa
3310666.374<aTtATGCATaAt
3412063.934<aTtATATATaAt
3511567.901>AATaAtAATaAt
3610366.47>AATtAgAATtAg
3710467.901>AATaAtAATaAt
3810665.38<tAaATTAATtTa
3911667.901>AATaAtAATaAt
410368.108>AATtAtAATtAt
4010867.738>AATtAaAATtAa
4110967.531>AATaAaAATaAa
4210367.901>AATaAtAATaAt
4310565.173>AATaTaAATaTa
4410168.108<aTaATTAATtAt
4510568.108<aTaATTAATtAt
4611465.75<aAaATTAATtTt
4710864.555>AAAtAtAAAtAt
4811065.628<tTcATTAATgAa
4913666.004>CATaAaCATaAa
510163.61<tTgATGCATcAa
5010466.211<tTaATGCATtAa
5110965.138>AATcAaAATcAa
5211067.901>AATaAtAATaAt
5310767.738<tTaATTAATtAa
5411566.211>CATtAaCATtAa
5510564.942<cTaATGCATtAg
5614067.901<aTtATTAATaAt
5712067.901<aTtATTAATaAt
5813467.901>AATaAtAATaAt
5911467.901<aTtATTAATaAt
610061.908>CAGtAaCAGtAa
6011467.901>AATaAtAATaAt
710465.998>AATgAtAATgAt
811062.584>CATtTgCATtTg
91026-0.7771<cCaTTTAAAtGg

The list of sites
 1    AATtAt
 10   CATtTg
 11   CATaAa
 12   GATcGt
 13   AATtAg
 14   AATaAa
 15   AATgCg
 16   CAAaTt
 17   CATtAa
 18   AATgAt
 19   AATaAg
 2    AATtAa
 20   CATtAt
 21   AATtAa
 22   AATaAt
 23   AATtAa
 24   AATtAc
 25   AATtAt
 26   CATaAa
 27   AATaTt
 28   AATgAt
 29   AATaAt
 3    AATtAa
 30   AATtAt
 31   AATtTa
 32   ATTaAa
 33   CATaAt
 34   TATaAt
 35   AATaAt
 36   AATtAg
 37   AATaAt
 38   AATtTa
 39   AATaAt
 4    AATtAt
 40   AATtAa
 41   AATaAa
 42   AATaAt
 43   AATaTa
 44   AATtAt
 45   AATtAt
 46   AATtTt
 47   AAAtAt
 48   AATgAa
 49   CATaAa
 5    CATcAa
 50   CATtAa
 51   AATcAa
 52   AATaAt
 53   AATtAa
 54   CATtAa
 55   CATtAg
 56   AATaAt
 57   AATaAt
 58   AATaAt
 59   AATaAt
 6    CAGtAa
 60   AATaAt
 7    AATgAt
 8    CATtTg
 9    AAAtGg