Looking for DNA motifs Gibbs sampler (SeSiMCMC) result.

Input FastA file name: 362949_0_03_MAR_21_25_02_extlz_sesimcmc.fasta

The best information content for different site lengthes:

Length
6-0.0412389
7-0.0324512
8-0.0311458
9-0.027863
10-0.0267843***
11-0.0342683
12-0.0327012

The sampler was looking for sites on both strands of 56 sequences of length from 213 through 298.

The site length found is 10.
The sampler has tested the lengths in [6,12].
The motif is formed by 56 motif sites.

All the positions are 0-based.

The description of sites
Gene IdPositionLengthScoreDirectionSite in sequenceSite-as-in-motif
110310-0.4069>agggGAAATcagggGAAATc
10105108.349<cAATTAaccatggtTAATTg
11104107.173<aAATTGattgcaatCAATTt
12101102.602<cACTCAcctcgaggTGAGTg
13107108.411<cAATTAatcatgatTAATTg
14147108.842>taaaTAATTataaaTAATTa
151241010.61<tAATTAatttaaatTAATTa
16110109.331<tAATTAttttaaaaTAATTa
17105105.581<cAATAGattgcaatCTATTg
18127106.559>ctaaTGATTactaaTGATTa
19109104.801>cttgTAAATacttgTAAATa
2102102.373<cAATTGcgcgcgcgCAATTg
20123105.878>atttTGATTtatttTGATTt
21145104.085>gaacTAAATtgaacTAAATt
22134107.974<cATTTAacttaagtTAAATg
23133106.115>taagTTATTataagTTATTa
24113105.806>gaagCAATTagaagCAATTa
25102108.949>aagtTGATTgaagtTGATTg
26106107.741>ctgcTAATTgctgcTAATTg
27105106.823<tACTTAactgcagtTAAGTa
28101104.897>cgatGGATTgcgatGGATTg
29100100.5624<tATCCGactgcagtCGGATa
3107105.101<cATTTCattataatGAAATg
30100108.488>tcgtTAATTgtcgtTAATTg
31107104.286>tagtCAATAatagtCAATAa
32132107.415>tcatTAATTttcatTAATTt
33111104.621>agagTCATTgagagTCATTg
34100105.512>cattTCATTtcattTCATTt
35103105.027>gcgcTAATTtgcgcTAATTt
36101108.432>aataTAATTgaataTAATTg
37100109.337>atgtTAATTaatgtTAATTa
381001010.5>aaatTAATTgaaatTAATTg
39106107.873<tAATTAttgtacaaTAATTa
4106105.227<tAATCTatttaaatAGATTa
40107107.943<cAATTAcatatatgTAATTg
41105107.118<tAATTAgtcatgacTAATTa
42104108.509<aAATTAaatgcattTAATTt
43124104.054<tTATCAtctgcagaTGATAa
44118103.515<cAATAGcatgcatgCTATTg
45105106.606<aAATTAgcagctgcTAATTt
4610210-0.2319<tCACCAtcggccgaTGGTGa
47104105.376<cCATTAaaaattttTAATGg
48112105.223<tCATTAgcagctgcTAATGa
49109105.731>attaTGATTgattaTGATTg
5100101.51<tCATGAtatcgataTCATGa
50104105.757>aaatCGATTtaaatCGATTt
51126104.004>gcaaTAAATagcaaTAAATa
52100101.933>atttGGATGgatttGGATGg
53100105.534>aaatGAATGaaaatGAATGa
54105102.032<tGATAAacaattgtTTATCa
55100109.084>ccatTAATTaccatTAATTa
56106105.366>acggGAATTaacggGAATTa
6109107.195<tAATTAgcgatcgcTAATTa
7102107.358>cggcTAATTgcggcTAATTg
8110109.714>aattTAATTgaattTAATTg
9103109.027>aagcTAATTgaagcTAATTg

The list of sites
 1    agggGAAATc
 10   tggtTAATTg
 11   caatCAATTt
 12   gaggTGAGTg
 13   tgatTAATTg
 14   taaaTAATTa
 15   aaatTAATTa
 16   aaaaTAATTa
 17   caatCTATTg
 18   ctaaTGATTa
 19   cttgTAAATa
 2    cgcgCAATTg
 20   atttTGATTt
 21   gaacTAAATt
 22   aagtTAAATg
 23   taagTTATTa
 24   gaagCAATTa
 25   aagtTGATTg
 26   ctgcTAATTg
 27   cagtTAAGTa
 28   cgatGGATTg
 29   cagtCGGATa
 3    taatGAAATg
 30   tcgtTAATTg
 31   tagtCAATAa
 32   tcatTAATTt
 33   agagTCATTg
 34   cattTCATTt
 35   gcgcTAATTt
 36   aataTAATTg
 37   atgtTAATTa
 38   aaatTAATTg
 39   acaaTAATTa
 4    aaatAGATTa
 40   tatgTAATTg
 41   tgacTAATTa
 42   cattTAATTt
 43   cagaTGATAa
 44   catgCTATTg
 45   ctgcTAATTt
 46   ccgaTGGTGa
 47   ttttTAATGg
 48   ctgcTAATGa
 49   attaTGATTg
 5    gataTCATGa
 50   aaatCGATTt
 51   gcaaTAAATa
 52   atttGGATGg
 53   aaatGAATGa
 54   ttgtTTATCa
 55   ccatTAATTa
 56   acggGAATTa
 6    tcgcTAATTa
 7    cggcTAATTg
 8    aattTAATTg
 9    aagcTAATTg