Looking for DNA motifs Gibbs sampler (SeSiMCMC) result.

Input FastA file name: 19447_0_03_MAR_21_51_26_extlz_sesimcmc.fasta

The best information content for different site lengthes:

Length
6-0.00100366
70.00984692
80.00783491
90.00924891
100.00793835
110.0102935***
12-0.00213655

The sampler was looking for sites on both strands of 16 sequences of length from 214 through 231.

The site length found is 11.
The sampler has tested the lengths in [6,12].
The motif is formed by 16 motif sites.

All the positions are 0-based.

The description of sites
Gene IdPositionLengthScoreDirectionSite in sequenceSite-as-in-motif
1102118.713>ttTAATTTGgtttTAATTTGgt
10102117.312>ttAAATGGTctttAAATGGTct
11103118.45>ctTCATTATggctTCATTATgg
12101117.906<gcGAAATTAaattTAATTTCgc
13102115.254>ggTAATGGGtgggTAATGGGtg
14103119.813>tgTAATTATtttgTAATTATtt
151021111.45>ttTAATTGTttttTAATTGTtt
16102119.394>ttTAATGACtattTAATGACta
2106117.406<cgGCTATTAagctTAATAGCcg
3107119.058>atTAATTATgaatTAATTATga
4105118.549<cgATAAGTAaattTACTTATcg
5103117.353<ctATCATTAgatcTAATGATag
6100117.28<aaACAATTAtcgaTAATTGTtt
71081110.71>ctTAATTACggctTAATTACgg
81041110.58<acATCATTAagctTAATGATgt
9102117.058<tgGCAATTAggccTAATTGCca

The list of sites
 1    ttTAATTTGgt
 10   ttAAATGGTct
 11   ctTCATTATgg
 12   ttTAATTTCgc
 13   ggTAATGGGtg
 14   tgTAATTATtt
 15   ttTAATTGTtt
 16   ttTAATGACta
 2    ctTAATAGCcg
 3    atTAATTATga
 4    ttTACTTATcg
 5    tcTAATGATag
 6    gaTAATTGTtt
 7    ctTAATTACgg
 8    ctTAATGATgt
 9    ccTAATTGCca